MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011312	CGA	2	6	3236439	3236444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_011312	CTT	2	6	3236473	3236478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_011312	GGT	2	6	3236516	3236521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_011312	CTTT	2	8	3236527	3236534	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16005	NC_011312	TCG	2	6	3236537	3236542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_011312	GGT	2	6	3236545	3236550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_011312	GGA	2	6	3239014	3239019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_011312	GTT	2	6	3239033	3239038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_011312	TTA	2	6	3239086	3239091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_011312	AAT	2	6	3239183	3239188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_011312	TAT	2	6	3239214	3239219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_011312	GTT	2	6	3239224	3239229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_011312	TTA	2	6	3241047	3241052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_011312	TGA	2	6	3243399	3243404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_011312	A	7	7	3243407	3243413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_011312	T	6	6	3243426	3243431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_011312	TTAA	2	8	3243489	3243496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_011312	TAAA	2	8	3243803	3243810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_011312	A	8	8	3243808	3243815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_011312	T	8	8	3243831	3243838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_011312	TTC	2	6	3244784	3244789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_011312	TGA	2	6	3244829	3244834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_011312	AAG	2	6	3246449	3246454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_011312	T	6	6	3249537	3249542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_011312	TTGA	2	8	3250961	3250968	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_011312	T	7	7	3251004	3251010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_011312	TGA	2	6	3251047	3251052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_011312	ATT	2	6	3251126	3251131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_011312	ATC	2	6	3252076	3252081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_011312	TC	3	6	3252146	3252151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16031	NC_011312	TTA	2	6	3252187	3252192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_011312	TTAA	2	8	3252202	3252209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_011312	TATTT	2	10	3252226	3252235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_011312	TGA	2	6	3252240	3252245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_011312	T	9	9	3252256	3252264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_011312	A	6	6	3252293	3252298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_011312	TAG	2	6	3252446	3252451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_011312	TAC	2	6	3252462	3252467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_011312	TAG	2	6	3252561	3252566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_011312	TGC	2	6	3252573	3252578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_011312	TG	3	6	3252691	3252696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_011312	AGCGA	2	10	3252867	3252876	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16043	NC_011312	TTTA	2	8	3252947	3252954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_011312	AAAG	2	8	3253014	3253021	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_011312	AAT	2	6	3253068	3253073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_011312	CTA	2	6	3253237	3253242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_011312	GAT	2	6	3253295	3253300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_011312	AG	3	6	3253330	3253335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_011312	ACG	2	6	3253339	3253344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_011312	TAG	2	6	3253452	3253457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_011312	TGC	2	6	3253464	3253469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_011312	CGCTT	2	10	3253567	3253576	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16053	NC_011312	TGA	2	6	3253607	3253612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_011312	CCT	2	6	3253629	3253634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16055	NC_011312	TTG	2	6	3253700	3253705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_011312	TCC	2	6	3253733	3253738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16057	NC_011312	AGG	2	6	3253789	3253794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_011312	T	7	7	3253826	3253832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_011312	T	6	6	3253904	3253909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_011312	ATG	2	6	3254759	3254764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_011312	TA	3	6	3254804	3254809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_011312	CAT	2	6	3254817	3254822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16063	NC_011312	TCGCT	2	10	3255874	3255883	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16064	NC_011312	GTG	2	6	3255904	3255909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_011312	T	6	6	3255972	3255977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_011312	A	6	6	3255980	3255985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_011312	A	7	7	3255987	3255993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_011312	ATG	2	6	3255996	3256001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_011312	ATC	2	6	3256012	3256017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16072	NC_011312	GATT	2	8	3256805	3256812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_011312	TAT	2	6	3256818	3256823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_011312	TA	3	6	3256827	3256832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_011312	ATAAA	2	10	3256849	3256858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_011312	AAAT	2	8	3256910	3256917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_011312	TCT	2	6	3256925	3256930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16078	NC_011312	GACTC	2	10	3256983	3256992	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16079	NC_011312	AGA	3	9	3257015	3257023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16083	NC_011312	TTA	2	6	3257081	3257086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_011312	ATGC	2	8	3257131	3257138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16085	NC_011312	A	7	7	3257234	3257240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16087	NC_011312	ATT	2	6	3257398	3257403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16089	NC_011312	TAA	2	6	3257460	3257465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_011312	AAC	2	6	3257489	3257494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16095	NC_011312	TTA	2	6	3257857	3257862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_011312	CAGA	2	8	3257899	3257906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16097	NC_011312	TGA	2	6	3258036	3258041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_011312	AGCG	2	8	3258074	3258081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16099	NC_011312	GAG	3	9	3258431	3258439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_011312	AC	3	6	3258447	3258452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16101	NC_011312	GCC	2	6	3258499	3258504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16102	NC_011312	AAC	2	6	3258527	3258532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_011312	ACG	2	6	3258538	3258543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16105	NC_011312	CAA	2	6	3258727	3258732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16107	NC_011312	TAT	2	6	3259117	3259122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16109	NC_011312	AGA	2	6	3259145	3259150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_011312	TTCGC	2	10	3259204	3259213	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16111	NC_011312	T	6	6	3259246	3259251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_011312	TAGT	2	8	3259287	3259294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_011312	AC	3	6	3259316	3259321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16114	NC_011312	GCGG	2	8	3259360	3259367	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16115	NC_011312	GAA	2	6	3259409	3259414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16119	NC_011312	T	6	6	3259555	3259560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_011312	TAT	2	6	3260758	3260763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16122	NC_011312	ATA	2	6	3260849	3260854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_011312	TAATT	2	10	3261514	3261523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16125	NC_011312	TGT	2	6	3267234	3267239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16389	NC_011312	ATA	2	6	3308674	3308679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16390	NC_011312	AATC	2	8	3308685	3308692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16391	NC_011312	CCT	2	6	3308698	3308703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16392	NC_011312	CAT	2	6	3309499	3309504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16393	NC_011312	CAT	2	6	3309677	3309682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16394	NC_011312	TAA	2	6	3309686	3309691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16395	NC_011312	GACTC	2	10	3309699	3309708	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16396	NC_011312	TGGC	2	8	3309747	3309754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16397	NC_011312	CAT	3	9	3309758	3309766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16398	NC_011312	TGC	2	6	3309806	3309811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16399	NC_011312	TGG	2	6	3309866	3309871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16400	NC_011312	AGCA	2	8	3309872	3309879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16401	NC_011312	AAG	2	6	3309907	3309912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16402	NC_011312	ACCAA	2	10	3309923	3309932	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
16403	NC_011312	ATTA	2	8	3310019	3310026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16404	NC_011312	CAT	2	6	3310037	3310042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16405	NC_011312	AT	3	6	3310140	3310145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16406	NC_011312	TCT	2	6	3310170	3310175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16407	NC_011312	TAA	2	6	3310181	3310186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16410	NC_011312	GTT	2	6	3310266	3310271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16411	NC_011312	GCA	2	6	3310395	3310400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16412	NC_011312	AAG	2	6	3310428	3310433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16413	NC_011312	CCA	2	6	3310438	3310443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16414	NC_011312	AGA	2	6	3310452	3310457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16416	NC_011312	GTG	2	6	3310558	3310563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16417	NC_011312	CAA	2	6	3310599	3310604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16420	NC_011312	T	6	6	3312006	3312011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16421	NC_011312	A	7	7	3312068	3312074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16422	NC_011312	CTT	3	9	3312088	3312096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16423	NC_011312	T	6	6	3313488	3313493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16424	NC_011312	TTA	2	6	3313517	3313522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16425	NC_011312	ATT	2	6	3313544	3313549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16426	NC_011312	ATT	2	6	3313562	3313567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16427	NC_011312	ATAA	2	8	3313569	3313576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16428	NC_011312	TAAG	2	8	3313637	3313644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16429	NC_011312	GCC	2	6	3313682	3313687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16430	NC_011312	TTCT	2	8	3313688	3313695	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16431	NC_011312	CCT	2	6	3314135	3314140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16432	NC_011312	TGT	3	9	3319402	3319410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16433	NC_011312	AT	3	6	3319431	3319436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16434	NC_011312	TTA	2	6	3319438	3319443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16435	NC_011312	TTC	2	6	3320661	3320666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16440	NC_011312	A	6	6	3325141	3325146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16441	NC_011312	TGA	2	6	3325147	3325152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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